L'idrossilammina HCL ha un uso industriale che comporta la produzione di un'altra sostanza (uso di sostanze intermedie). Questo prodotto viene utilizzato principalmente come agente riducente e agente di imaging, sintesi organica per la preparazione di ossima e anche come materia prima per la sintesi di farmaci antitumorali (idrossiurea), sulfamidici (sinomin), farmaci antiraffreddore e pesticidi (metomil). Viene utilizzato come depolarizzante in elettroanalisi, nell'industria della gomma sintetica come agente terminante a breve termine non macchiante.