Guanidine Hydrochloride Buffer là một chất biến tính protein mạnh có chức năng như một tác nhân hỗn loạn. Là một chất biến tính, nó hoạt động để mở ra các protein và biến chúng thành chuỗi polypeptide ban đầu của chúng. Là một tác nhân hỗn loạn, nó phá vỡ cấu trúc của protein. Guanidine Hydrochloride Buffer thường được sử dụng trong việc tinh chế RNA bằng cách phân tách RNA thành axit nucleic và dạng protein. Ở nồng độ cao hơn, Guanidine Hydrochloride Buffer làm giảm hoạt động của enzyme. Nó cũng được sử dụng để tăng độ hòa tan của các phân tử kỵ nước.